創建由来不詳ですが天永年間（1110-1112）に勧請されたと言われています。
新編武蔵風土記稿（1828）に「北方村字泉谷に太神宮あり」があり、本郷村の北に位置した北方村の皇太神宮は、横浜山手の高台に元は鎮座し、慶応年間、外国人居留地となり、明治三年（1870）現在地に鎮座し今に至ります。