寛保元年（1741）創建。
日吉神社の東隣に位置する大日堂は天台宗の寺院で東京都有形文化財の仏像が祀られ、神仏習合の時代には日吉神社（当時は山王社と呼ばれていた）を管理していた。
例祭は榊祭（さかきまつり）とも呼ばれ、1767年から始まった貴重な伝統行事であり東京都無形民俗文化財に指定。